Калифорния университетінің ғалымдары ЖИ көмегімен жасырын ДНҚ тізбегін ашты
Материал бірнеше дереккөз негізінде жасанды интеллектпен дайындалды — түпнұсқаларға сілтемелер төменде.
Сан-Диегодағы Калифорния университетінің ғалымдары машиналық оқыту арқылы ген экспрессиясының негізгі элементі — инициатор ДНҚ тізбегін анықтады. ЖИ моделі адам гендерінің шамамен 60%-ында инициатор бар екенін болжайды. Нәтижелер мутациялардың ген белсенділігі мен аурулардың дамуына әсерін болжауға көмектеседі.
Негізгі фактілер
- Зерттеуде инициатордың шамамен 500 000 түрлі нұсқасы үшін ген экспрессиясының белсенділігі өлшенді.
- ЖИ моделі адам гендерінің шамамен 60%-ында инициатор тізбегі бар екенін көрсетті.
- Зерттеуді Сан-Диегодағы Калифорния университетінде профессор Джеймс Т. Кадонага зертханасында аспирант Торри Райн-Карригг басқарды.
- Нәтижелер гендерді қосу немесе өшіру үшін берілген функциялары бар синтетикалық промоторларды әзірлеуге көмектесуі мүмкін.
ЖИ көмегімен ашу әдісі
Команда инициатордың шамамен 500 000 түрлі нұсқасы үшін ген экспрессиясының белсенділігін өлшеу үшін жоғары өнімді ДНҚ секвенирлеуін қолданды. Бұл нәтижелер машиналық оқыту жүйесін инициатормен байланысты ДНҚ-ның тән үлгісін тануға үйрету үшін пайдаланылды. Модель бұл қолтаңбаны ашқаннан кейін команда адам гендерін тексеріп, олардың шамамен 60%-ында инициатор бар екенін анықтады. Профессор Джеймс Т. Кадонага ЖИ модельдері алғаш рет адам гендерінде инициатордың бар немесе жоқ екенін жоғары дәлдікпен болжауға мүмкіндік бергенін айтты.
Ықтимал қолдану салалары
Нәтижелер зерттеушілерге инициаторға әсер ететін мутациялар ген белсенділігін қалай өзгертетінін және әртүрлі аурулардың дамуына ықпал ететінін болжауға көмектесуі мүмкін. Зерттеу деректері мен ЖИ модельдері синтетикалық промоторларды — нақты мақсаттарға бейімделген функциялары бар гендерді қоса алатын немесе өшіре алатын тізбектерді әзірлеуге де көмектесуі мүмкін. Кадонага бұл жұмыс адам ДНҚ-сындағы ақпаратты ашу үшін зертханалық эксперименттер мен ЖИ-ді бірлесіп қолданудағы алға қадам екенін атап өтті. Ол жақын болашақта адам ген экспрессиясы коды үшін ЖИ модельдерін кеңейтуге қатысты оптимизм білдірді.
1 дереккөз
Калифорния университетінің ғалымдары ЖИ көмегімен жасырын ДНҚ тізбегін ашты
