Ғалымдар Альцгеймер ауруының жаңа қабатын геномның 3D құрылымынан тапты
Материал бірнеше дереккөз негізінде жасанды интеллектпен дайындалды — түпнұсқаларға сілтемелер төменде.
Карнеги-Меллон университеті, Питтсбург университеті және Вашингтон университетінің зерттеушілері Альцгеймер ауруы бар адамдардың ми жасушаларында геномның үш өлшемді ұйымдасуы ерекшеленетінін анықтады. Science журналында жарияланған зерттеу геномның бүктелуіндегі бұл өзгерістерді ген белсенділігі мен ми тінінің ұйымдасуындағы ығысулармен байланыстырды. Команда бір жасушалық технологияны, кеңістіктік карталауды және терең оқыту моделін біріктіріп, толық көрініс жасады.
Негізгі фактілер
- Зерттеу Science журналында жарияланды, оған Карнеги-Меллон университеті, Питтсбург университеті және Вашингтон университетінің зерттеушілері қатысты.
- Зерттеушілер деменция бойынша ұзақ мерзімді зерттеуге қатысқан Альцгеймер ауруы бар және жоқ адамдардың префронтальды қыртысының қайтыс болғаннан кейінгі үлгілерін зерттеді.
- Команда GAGE-seq әдісін қолданды — бұл әдіс бір жасушада ген экспрессиясы мен геномның үш өлшемді байланыстарын өлшейді.
- Карнеги-Меллон университетіндегі Рэй және Стефани Лейн атындағы есептеу биологиясы профессоры Цзянь Ма зерттеуді басқарып, жетекшілік етті.
- Питтсбург университетінің нейробиология доценті Хансруди Матис зерттеудің Питтсбург бөлігін басқарды.
Геном бүктелуіндегі айырмашылықтар
Геномның үш өлшемді ұйымдасуы Альцгеймер ауруы бар адамдардың белгілі бір ми жасушаларында ерекшеленеді. Геномның бүктелуіндегі бұл өзгерістер ген белсенділігі мен ми тінінің ұйымдасуындағы ығысулармен байланысты. ДНҚ күрделі үш өлшемді құрылымға бүктеледі, бұл қандай гендердің қолжетімді және белсенді екенін анықтауға көмектеседі. Бұл физикалық ұйымдасудағы өзгерістер жасушалардың жұмысына әсер етуі мүмкін.
Зерттеу әдістері
Команда бір жасушалық технологияны, ми тінінің кеңістіктік карталауын және жаңа терең оқыту моделін біріктірді. GAGE-seq өлшемдері бұзылмаған ми тінінде ген белсенділігі қайда жүретіні туралы ақпаратты сақтайтын кеңістіктік транскриптомдық карталармен біріктірілді. Осы деректер жиындарын біріктіре отырып, зерттеушілер геномның физикалық ұйымдасуын ген реттелуімен байланыстырды, сонымен бірге Альцгеймер ауруымен байланысты молекулалық және жасушалық өзгерістердің қоршаған тінде қайда пайда болатынын көрді.
Зерттеу жетекшілігі
Карнеги-Меллон университетіндегі Рэй және Стефани Лейн атындағы есептеу биологиясы профессоры Цзянь Ма зерттеуді басқарып, жетекшілік етті. Питтсбург университетінің нейробиология доценті Хансруди Матис зерттеудің Питтсбург бөлігін басқарды. Зерттеуге Карнеги-Меллон университетінің Рэй және Стефани Лейн атындағы есептеу биологиясы бөлімінің, Питтсбург университетінің нейробиология бөлімінің ғалымдары және ынтымақтастық мекемелер қатысты.
1 дереккөз
Уақыт · артта қалуы