Nature журналы әртүрлі масштабтағы кеңістіктік протеомика деректерін біріктіретін Virtual Tissues моделін жариялады
Материал бірнеше дереккөз негізінде жасанды интеллектпен дайындалды — түпнұсқаларға сілтемелер төменде.
Зерттеушілер Nature журналында кеңістіктік протеомика үшін Virtual Tissues (VirTues) іргелі моделін ұсынды, ол әртүрлі платформалар мен ісік түрлерінен алынған ақуыз бейнелеу деректерін біріктіреді. Бұл әзірлеме сенімді биомаркерлер табуға және пациенттерді стратификациялауға, сондай-ақ стандартты емес панельдер мен протоколдардан туындаған деректер бытыраңқылығын жоюға мүмкіндік береді.
VirTues іргелі моделі
Virtual Tissues (VirTues) — мультиплексті кескіндерден тікелей ақуыз, жасуша, тауаша және тін репрезентацияларын үйренетін маркерге бағытталған мультимасштабты іргелі модель. Ол маркерлерді қайта құру, жасушаларды сегментациялау және типтеу, тауашаларды аннотациялау және кеңістіктік биомаркерлерді іздеу сияқты міндеттерді шешеді. Негізгі ерекшелігі — гетерогенді антидене панельдері мен деректер жиынтығында нөлдік түсіру аннотациясын жасау мүмкіндігі, бұл белгіленген маркерлер жиынын болжайтын әдеттегі кодерлерге қолжетімсіз. Модель әртүрлі онкологиялық когорттардағы кескіндер корпусында алдын ала оқытылған, бірақ үйрету үлгілерінің нақты саны ашылмайды. Сынақтарда VirTues көмегімен алынған биомаркерлер үштік теріс сүт безі обырында анти-PD-L1 химиоиммунотерапияға жауапты болжады және прогрессиясыз өмір сүруді стратификациялады, қолданыстағы клиникалық стратификация схемаларынан асып түсті.
Үштік теріс сүт безі обырында клиникалық валидация
Зерттеушілер командасы VirTues-ті үштік теріс сүт безі обыры бар пациенттердің деректерінде бағалады. Модель биомаркерлері бір когортада анти-PD-L1 химиоиммунотерапияға жауапты болжады және тәуелсіз когортада прогрессиясыз өмір сүруді стратификациялады. Ағымдағы клиникалық стратификациямен және дәл сол деректер жиынтығынан алынған озық биомаркерлермен салыстырғанда, VirTues жоғары өнімділік көрсетті.
1 дереккөз
Уақыт · артта қалуы