База данных AlphaFold пополнилась 8 тыс. вирусных белковых комплексов
Материал подготовлен искусственным интеллектом на основе нескольких источников — ссылки на оригиналы приведены ниже.
24 сентября 2026 года исследователи добавили в базу данных белковых структур AlphaFold более 8 тыс. димеров вирусных белков. Добавленные структуры охватывают 23 семейства вирусов, поражающих человека, и открывают портал готовности к пандемиям. Это закрывает пробел в структурных данных о вирусных белках, которые часто действуют в комплексах.
Ключевые факты
- 24 сентября 2026 года в базу данных белковых структур AlphaFold добавлено более 8 тыс. димеров вирусных белков.
- Добавленные белки относятся к 23 семействам вирусов, поражающих человека, включая вирусы оспы обезьян, кори и гепатита B.
- Исследователи проанализировали последовательности 41 774 белков примерно из 2 800 вирусов.
- База данных поддерживается Европейским институтом биоинформатики EMBL-EBI в Хинкстоне, Великобритания, и насчитывает более трёх миллионов пользователей.
- Ранее в 2026 году в базу были добавлены предсказанные структуры 1,7 млн пар взаимодействующих белков из 20 широко изучаемых организмов.
Пробел в вирусных белках
Вирусы оставались пробелом в базе данных AlphaFold, несмотря на охват большинства известных белков. Для многих отдельных вирусных белков, например флавивирусов, включая вирусы Зика и денге, отсутствуют качественные записи. При репликации некоторых вирусов их РНК сначала транслируется в полипротеин, который затем разрезается на отдельные функциональные молекулы. Из-за этого по генетической последовательности не всегда ясно, где начинается и заканчивается вирусный белок, что приводит к неполным предсказаниям структуры.
Портал готовности к пандемиям
Добавление вирусных белков является частью запуска портала готовности к пандемиям в базе данных AlphaFold. Исследователи из Швейцарского института биоинформатики в Женеве определили точные последовательности тысяч вирусных белков, вырезаемых из полипротеинов. Джо Гроув, молекулярный вирусолог из Университета Глазго, Великобритания, отметил, что многие вирусные белки действуют совместно с партнёрами. Команда использовала AlphaFold2 для предсказания структур 40 746 гомодимеров и почти 1,7 млн гетеродимеров.
1 источник
Время · отставание