Nature публикует анализ коннектома мозжечкоподобной цепи электрической рыбы

Материал подготовлен искусственным интеллектом на основе нескольких источников — ссылки на оригиналы приведены ниже.
Исследователи опубликовали анализ коннектома мозжечкоподобной цепи, отвечающей за сенсорное предсказание, у электрической рыбы. В работе представлена полная схема связей электросенсорной доли. Данные и код находятся в открытом доступе.
Ключевые факты
- В исследовании представлен полный коннектом электросенсорной доли электрической рыбы.
- Данные доступны в формате для просмотра и через API с помощью Neuroglancer.
- Обработанные данные и код размещены в репозитории Zenodo с DOI 10.5281/zenodo.19892261.
- На странице проекта приведены ссылки на весь код анализа на Python 3.8+ и MATLAB 2024b.
Набор данных коннектома
В работе представлен полный коннектом мозжечкоподобной цепи электрической рыбы. Набор данных включает оригинальные данные электронной микроскопии и сегментации. Данные доступны через Neuroglancer в форматах для просмотра и предварительно вычисленных форматах. На специальной веб-странице проекта указаны публичные адреса Google Storage для каждого компонента набора данных.
Код и воспроизводимость
Весь код анализа написан на Python 3.8 или выше и доступен на GitHub. Код для реализации моделей написан на MATLAB 2024b и также находится в открытом доступе. Архив Zenodo включает пользовательский код на Python и MATLAB с документацией. Ранее опубликованный код, использованный в исследовании, указан в списке литературы.