Ученые из Калифорнийского университета расшифровали скрытую последовательность ДНК с помощью ИИ
Материал подготовлен искусственным интеллектом на основе нескольких источников — ссылки на оригиналы приведены ниже.
Ученые из Калифорнийского университета в Сан-Диего расшифровали последовательность ДНК инициатора, ключевого элемента экспрессии генов, с помощью машинного обучения. Модель ИИ предсказывает наличие инициатора примерно в 60% генов человека. Результаты помогут прогнозировать, как мутации влияют на активность генов и развитие заболеваний.
Ключевые факты
- В исследовании измерялась активность экспрессии генов примерно для 500 000 различных вариантов инициатора.
- Модель ИИ показала, что примерно 60% генов человека содержат последовательность инициатора.
- Исследование возглавил аспирант Торри Райн-Карригг в лаборатории профессора Джеймса Т. Кадонаги в Калифорнийском университете в Сан-Диего.
- Результаты могут помочь в разработке синтетических промоторов с заданными функциями для включения или выключения генов.
Метод расшифровки с помощью ИИ
Команда использовала высокопроизводительное секвенирование ДНК для измерения активности экспрессии генов примерно для 500 000 различных вариантов инициатора. Эти результаты использовались для обучения системы машинного обучения распознавать характерный паттерн ДНК, связанный с инициатором. После того как модель расшифровала эту сигнатуру, команда проверила гены человека и обнаружила, что примерно 60% из них содержат инициатор. Профессор Джеймс Т. Кадонага заявил, что модели ИИ впервые позволили с высокой точностью предсказывать наличие или отсутствие инициатора в генах человека.
Возможные применения
Результаты могут помочь исследователям предсказывать, как мутации, затрагивающие инициатор, могут изменять активность генов и способствовать развитию различных заболеваний. Данные исследования и модели ИИ также могут помочь в разработке синтетических промоторов — последовательностей, способных включать или выключать гены, с функциями, адаптированными для конкретных целей. Кадонага отметил, что эта работа является шагом вперед в совместном использовании лабораторных экспериментов и ИИ для расшифровки информации, заложенной в ДНК человека. Он выразил оптимизм по поводу расширения моделей ИИ для кода экспрессии генов человека в ближайшем будущем.
1 источник
Ученые из Калифорнийского университета расшифровали скрытую последовательность ДНК с помощью ИИ
